Jens Schmidl wurde in Lörrach/Rhein geboren. Nach Abschluss seines Studiums der Theaterwissenschaft und Germanistik in München (LMU) und Berlin (FU) arbeitete er zunächst als Regieassistent am Staatstheater Kassel, an der Schaubühne am Lehniner Platz (Berlin) u.a. bei Jürgen Gosch, Klaus Michael Grüber und Peter Stein, sowie bei den Salzburger Festspielen. Als Regisseur folgten seit 1990 zahlreiche Inszenierungen, u.a. am Staatstheater Kassel, der Schaubühne Berlin, dem Volkstheater Wien, am Staatstheater Hannover, am Deutschen Theater Göttingen, den Theatern Konstanz und Heilbronn wie am Landestheater Rudolstadt.
Neben seiner Regietätigkeit hat Jens Schmidl eine umfangreiche Lehrtätigkeit zu verzeichnen: Er lehrt szenischen Unterricht an der Universität der Künste Berlin, an der Hochschule für Musik und Theater Hannover und im Jahr 2006 an der University of Toronto. Jens Schmidl ist Autor mehrerer Drehbücher und Theaterstücke und war als Filmregisseur und Bühnenbildner tätig.